1983.- Aprobada la Ley de Reforma Universitaria, se amplia su estructura orgánica con la creación de una Dirección General de Universidades.
1984.- Pasa a denominarse Consejería de Educación y Ciencia.
1994 y 1995.- Traspaso competencial en materia de investigación científica y desarrollo y transferencia tecnológicos con la Consejería de Industria, Comercio y Turismo.
- Retoma la antigua denominación de Consejería de Educación ya que las competencias en materia de universidades e investigación pasan a ser ejercidas por la recién creada Consejería de Innovación, Ciencia y Empresa.
2008.- El Decreto del Presidente 10/2008, de 29 de abril, asigna a la Consejería de Educación las competencias atribuidas hasta ese momento a la Consejería para la Igualdad y Bienestar Social, en relación con los centros de atención socioeducativa para menores de tres años. Asimismo, el Decreto 121/2008, de 29 de abril, por el que se regula la estructura orgánica, adscribe a la Consejería el Instituto Andaluz de Enseñanzas Artísticas Superiores y la Agencia Andaluza de Evaluación Educativa, agencias administrativas creadas en la Ley 17/2007, de 10 de diciembre, de Educación de Andalucía (art. 92 y 160, respectivamente).
2013.- La Consejería de Educación, Cultura y Deporte asume las competencias asignadas anteriormente ala Consejería de Educación y la Consejería de Cultura y Deporte.
2015.- La Consejería de Educación asume las competencias que tenía atribuidas la Consejería de Educación, Cultura y Deporte en materia de educación, excepto las referidas a formación profesional para el empleo.